新三板与四板的服务对象有所重叠，二者都服务于非上市公司，而且公司定位都是在各行业、各地区高科技、高成长性的，相对优质的企业。除此之外，两个市场间存在巨大差异。有观点从称"三板只是扩大版的四板"是完全错误的。

　　三板与四板的差别主要体现以下几个方面：

　　1.交易标的不同。新三板是纯粹的股权交易平台，交易标的是非上市股份有限公司的股权；产权交易所则没有区分资产与股权的概念，交易标的包含股权，也涉及知识产权、技术产权、金融业产权等企业资产。严格意义来讲，产权交易所并不能被视为我国的证券市场的一部分，目前只能归其"场外交易市场"。

　　2.市场性质和监管机构不同，新三板是证监会监管的全国性证券交易所，而四板是地方政府设立并监管的私募市场。一个是"全国粮票"，一个是"地方粮票"。

　　3.交易规则不同，企业股票在新三板交易可以通过协议转让、做市、竞价等方式，股票交易单位1000股/手，实施T+交收；四板一般不存在线上交易系统，仅采取协议转让方式进行交易，交易遵循"非公开、非标准、非连续"原则，旨在锁定风险向社会溢出。

　　4.挂牌公司不同。新三板的挂牌公司一定是符合条件的非上市股份有限公司，股东人数可以超过200人；地方股交所的交易主体并无此要求，股份公司、有限公司、甚至拥有经营性国有资产的事业单位，都可以成为交易主体，股东人数不能超过200人。